自然流产连续发生2-3次者，就属于习惯性流产。引起习惯性流产的疾病大约有43种疾病1、 免疫因素占67％。2、 解剖因素占14％。3、 内分泌因素11％。4、 遗传因素占5％。5、 其它因素占3％。例如，内分泌失调、免疫异常、染色体缺陷、感染、子宫内膜太薄、黄体功能欠佳等都是可能的病因。
病因检查有先后：习惯性流产给患者带来沉重的身心创伤，她们经过多方打听，发现流产的病因那么多，心下更是彷徨、焦急：到底该先查什么后查什么？能不能干脆所有的项目一起做？有的患者为了“提高效率”，甚至隐瞒刚刚流产的病史，只是为了早早地开始应该流产3个月后才能进行的免疫检查。一般地说，习惯性流产的女性在准备再次怀孕前，需首先排除非免疫性病因，因为内分泌功能的异常是可用药物调整的，某些染色体异常引起流产是目前医学无法解决的，而子宫形态异常、宫腔粘联等问题要靠手术解决。如果上述检查均正常，就应考虑进行免疫相关因素检查了。临床上，约 80% 的习惯性流产与免疫异常有关。也就是说，怀孕期女方体内产生了针对男方的免疫反应，导致胚胎无法在母亲体内存活，引起了流产。免疫病因分类必须正确，才能选择更高效的治疗方案。对患者来说，耐心等待、配合检查就非常重要。如果在流产后身体没有完全恢复的情况下就开始免疫检查，各项指标都没有达到稳定状况，不能反映真实的情况。
需要检查的项目：内分泌因素基有基础体温，血雌激素、孕激素，泌乳素等；感染因素有白带检查、弓形虫、支原体、衣原体、巨细胞病毒、单纯疱疹病毒、风疹病毒等；生殖器因素有子宫输卵管造影、宫腔镜检查等；遗传因素夫妇双方染色体核型分析；免疫因素有透明带抗体，磷脂抗体，ABO血型抗体，封闭抗体，封闭抗体抗独特型抗体等。注意以上检查在除外男方精液异常后进行。
免疫病因分三类。免疫检查的项目非常复杂，很多患者抱怨，看不懂检查结果，有些人则简单地认为抗体指标“阳性”就是糟糕，“阴性”就说明没问题，实际远没那么简单。这里只能选择两项比较重要的检查简要分析，更详细的情况还要听取医生的当面解释。
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